MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 179924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018289	CTG	2	6	5	10	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
2	NC_018289	TCG	2	6	26	31	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
3	NC_018289	CGT	2	6	45	50	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
4	NC_018289	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
5	NC_018289	CTG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
6	NC_018289	CGA	2	6	303	308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
7	NC_018289	CGG	2	6	362	367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984433
8	NC_018289	GCCGAC	2	12	373	384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399984433
9	NC_018289	CGA	3	9	390	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
10	NC_018289	TCG	2	6	466	471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
11	NC_018289	CCG	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984433
12	NC_018289	CGC	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984433
13	NC_018289	GTT	2	6	600	605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399984433
14	NC_018289	CTG	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
15	NC_018289	TCA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984433
16	NC_018289	GAC	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
17	NC_018289	CGT	2	6	758	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
18	NC_018289	CGACAT	2	12	780	791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399984433
19	NC_018289	CTG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
20	NC_018289	CGA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
21	NC_018289	AAGG	2	8	826	833	50 %	0 %	50 %	0 %	399984433
22	NC_018289	AGG	2	6	839	844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984433
23	NC_018289	TTC	2	6	847	852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399984433
24	NC_018289	CAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399984433
25	NC_018289	TCG	2	6	898	903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
26	NC_018289	GCC	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984433
27	NC_018289	AGC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
28	NC_018289	TCA	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984433
29	NC_018289	GCC	2	6	984	989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984433
30	NC_018289	AAG	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399984433
31	NC_018289	GAT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399984433
32	NC_018289	CAG	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984433
33	NC_018289	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399984433
34	NC_018289	TGC	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984433
35	NC_018289	CCA	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984433
36	NC_018289	CAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984433
37	NC_018289	CCG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984433
38	NC_018289	GAG	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984433
39	NC_018289	ACCAC	2	10	1397	1406	40 %	0 %	0 %	60 %	399984433
40	NC_018289	GAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399984433
41	NC_018289	CAC	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984433
42	NC_018289	GC	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	399984433
43	NC_018289	CGT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984434
44	NC_018289	CGA	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984434
45	NC_018289	T	6	6	1614	1619	0 %	100 %	0 %	0 %	399984434
46	NC_018289	TGCC	2	8	1643	1650	0 %	25 %	25 %	50 %	399984434
47	NC_018289	CGG	2	6	1659	1664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984434
48	NC_018289	GC	3	6	1690	1695	0 %	0 %	50 %	50 %	399984434
49	NC_018289	TC	3	6	1718	1723	0 %	50 %	0 %	50 %	399984434
50	NC_018289	CGA	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984434
51	NC_018289	CGG	2	6	1750	1755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984434
52	NC_018289	TCA	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984434
53	NC_018289	CA	3	6	1774	1779	50 %	0 %	0 %	50 %	399984434
54	NC_018289	AC	3	6	1794	1799	50 %	0 %	0 %	50 %	399984434
55	NC_018289	AGA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399984434
56	NC_018289	GA	3	6	1923	1928	50 %	0 %	50 %	0 %	399984434
57	NC_018289	CGAT	2	8	1955	1962	25 %	25 %	25 %	25 %	399984434
58	NC_018289	CGG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984434
59	NC_018289	CTG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984434
60	NC_018289	CGA	3	9	2113	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984435
61	NC_018289	GGCTG	2	10	2123	2132	0 %	20 %	60 %	20 %	399984435
62	NC_018289	CGT	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984435
63	NC_018289	CCA	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984435
64	NC_018289	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984435
65	NC_018289	CCG	2	6	2326	2331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984435
66	NC_018289	GCT	2	6	2354	2359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984435
67	NC_018289	GC	4	8	2440	2447	0 %	0 %	50 %	50 %	399984435
68	NC_018289	CTGC	2	8	2487	2494	0 %	25 %	25 %	50 %	399984435
69	NC_018289	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984435
70	NC_018289	GGTGGC	2	12	2552	2563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	399984435
71	NC_018289	CGA	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984435
72	NC_018289	GTG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984435
73	NC_018289	CGC	2	6	2636	2641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984435
74	NC_018289	GACC	2	8	2642	2649	25 %	0 %	25 %	50 %	399984435
75	NC_018289	CAC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984435
76	NC_018289	GCC	2	6	2742	2747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984435
77	NC_018289	ACGG	2	8	2757	2764	25 %	0 %	50 %	25 %	399984435
78	NC_018289	GTCG	2	8	2798	2805	0 %	25 %	50 %	25 %	399984435
79	NC_018289	GCA	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984435
80	NC_018289	GCT	2	6	2891	2896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984435
81	NC_018289	CCG	2	6	2899	2904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984435
82	NC_018289	CGA	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984435
83	NC_018289	CGA	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984435
84	NC_018289	CAC	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984435
85	NC_018289	CGGC	2	8	3198	3205	0 %	0 %	50 %	50 %	399984435
86	NC_018289	GAT	2	6	3213	3218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399984435
87	NC_018289	GGT	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984435
88	NC_018289	GCC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984435
89	NC_018289	CTG	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984435
90	NC_018289	GAG	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984436
91	NC_018289	CGTGT	2	10	3484	3493	0 %	40 %	40 %	20 %	399984436
92	NC_018289	CGG	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984436
93	NC_018289	CGCA	2	8	3611	3618	25 %	0 %	25 %	50 %	399984436
94	NC_018289	TTG	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399984436
95	NC_018289	GT	3	6	3659	3664	0 %	50 %	50 %	0 %	399984436
96	NC_018289	CGG	2	6	3666	3671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984436
97	NC_018289	CGG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984436
98	NC_018289	GAC	3	9	3718	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984436
99	NC_018289	CCG	2	6	3763	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984436
100	NC_018289	GGTG	2	8	3804	3811	0 %	25 %	75 %	0 %	399984436
101	NC_018289	CTG	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984436
102	NC_018289	TCA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984436
103	NC_018289	GTG	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984436
104	NC_018289	GAG	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984436
105	NC_018289	GGT	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984436
106	NC_018289	TCGATC	2	12	4283	4294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399984437
107	NC_018289	TTG	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399984437
108	NC_018289	CGC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984437
109	NC_018289	CG	3	6	4432	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
110	NC_018289	TCG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984437
111	NC_018289	CAA	2	6	4509	4514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399984437
112	NC_018289	TGC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984437
113	NC_018289	GC	3	6	4569	4574	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
114	NC_018289	GTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399984437
115	NC_018289	TC	3	6	4596	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	399984437
116	NC_018289	CGA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984437
117	NC_018289	GC	3	6	4683	4688	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
118	NC_018289	GGT	2	6	4701	4706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984437
119	NC_018289	CGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984437
120	NC_018289	CGGCG	2	10	4812	4821	0 %	0 %	60 %	40 %	399984437
121	NC_018289	CG	3	6	4832	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
122	NC_018289	TCG	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984437
123	NC_018289	GCA	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984437
124	NC_018289	GC	3	6	5005	5010	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
125	NC_018289	GTG	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984437
126	NC_018289	TG	3	6	5037	5042	0 %	50 %	50 %	0 %	399984437
127	NC_018289	TCG	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984437
128	NC_018289	CGA	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984437
129	NC_018289	GCCA	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	399984437
130	NC_018289	TGT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399984437
131	NC_018289	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984437
132	NC_018289	CGA	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984437
133	NC_018289	GGC	2	6	5234	5239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984437
134	NC_018289	GC	4	8	5238	5245	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
135	NC_018289	GGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984437
136	NC_018289	CG	3	6	5322	5327	0 %	0 %	50 %	50 %	399984437
137	NC_018289	GAC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984437
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139	NC_018289	CGA	3	9	5399	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984438
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142	NC_018289	GAG	2	6	5493	5498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984438
143	NC_018289	CGCGG	2	10	5502	5511	0 %	0 %	60 %	40 %	399984438
144	NC_018289	CGGCCG	2	12	5534	5545	0 %	0 %	50 %	50 %	399984438
145	NC_018289	CGGCC	2	10	5549	5558	0 %	0 %	40 %	60 %	399984438
146	NC_018289	ACT	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984438
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149	NC_018289	CGC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984438
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155	NC_018289	GAC	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_018289	CGA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984439
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160	NC_018289	CGA	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984439
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172	NC_018289	CGT	2	6	6863	6868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984439
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245	NC_018289	TGGTC	2	10	9436	9445	0 %	40 %	40 %	20 %	399984440
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248	NC_018289	GCT	2	6	9529	9534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
249	NC_018289	CGA	2	6	9541	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
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252	NC_018289	TCG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
253	NC_018289	CGTG	2	8	9694	9701	0 %	25 %	50 %	25 %	399984440
254	NC_018289	TCG	2	6	9717	9722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
255	NC_018289	CG	3	6	9736	9741	0 %	0 %	50 %	50 %	399984440
256	NC_018289	CCG	2	6	9759	9764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984440
257	NC_018289	CGA	2	6	9778	9783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
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259	NC_018289	GACC	2	8	9850	9857	25 %	0 %	25 %	50 %	399984440
260	NC_018289	CGG	2	6	9877	9882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984440
261	NC_018289	GAC	2	6	9914	9919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
262	NC_018289	CTT	2	6	9931	9936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399984440
263	NC_018289	TTC	2	6	9965	9970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399984440
264	NC_018289	CA	3	6	9973	9978	50 %	0 %	0 %	50 %	399984440
265	NC_018289	CG	3	6	10030	10035	0 %	0 %	50 %	50 %	399984440
266	NC_018289	CCT	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399984440
267	NC_018289	GAG	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399984440
268	NC_018289	GAA	2	6	10156	10161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399984440
269	NC_018289	CGG	2	6	10195	10200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984440
270	NC_018289	TCG	2	6	10203	10208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
271	NC_018289	CGA	2	6	10228	10233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
272	NC_018289	CGGTG	2	10	10240	10249	0 %	20 %	60 %	20 %	399984440
273	NC_018289	GAC	2	6	10265	10270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
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275	NC_018289	GAC	2	6	10382	10387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984440
276	NC_018289	CTG	2	6	10391	10396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
277	NC_018289	CGT	2	6	10405	10410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
278	NC_018289	CTG	2	6	10427	10432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
279	NC_018289	TCGA	2	8	10466	10473	25 %	25 %	25 %	25 %	399984440
280	NC_018289	CGG	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984440
281	NC_018289	TCG	2	6	10560	10565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984440
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283	NC_018289	GGT	2	6	10601	10606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399984440
284	NC_018289	TGA	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399984440
285	NC_018289	AC	3	6	10689	10694	50 %	0 %	0 %	50 %	399984440
286	NC_018289	GGACGA	2	12	10717	10728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	399984440
287	NC_018289	GGC	2	6	10729	10734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984440
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290	NC_018289	CCGG	2	8	10880	10887	0 %	0 %	50 %	50 %	399984441
291	NC_018289	CCA	2	6	10891	10896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984441
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293	NC_018289	CAG	2	6	10931	10936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399984441
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296	NC_018289	GGTCC	2	10	11154	11163	0 %	20 %	40 %	40 %	399984441
297	NC_018289	CAC	2	6	11216	11221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399984441
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299	NC_018289	CCG	2	6	11282	11287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984441
300	NC_018289	TTC	2	6	11340	11345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399984441
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303	NC_018289	CTG	2	6	11430	11435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984441
304	NC_018289	CGAGCG	2	12	11437	11448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399984441
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313	NC_018289	TG	3	6	12018	12023	0 %	50 %	50 %	0 %	399984443
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352	NC_018289	GCG	2	6	13658	13663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984444
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377	NC_018289	GT	3	6	14513	14518	0 %	50 %	50 %	0 %	399984445
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380	NC_018289	GCG	2	6	14672	14677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399984445
381	NC_018289	GCC	2	6	14705	14710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399984445
382	NC_018289	TGC	3	9	14781	14789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399984445
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385	NC_018289	CAT	2	6	14997	15002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399984446
386	NC_018289	TGCC	2	8	15023	15030	0 %	25 %	25 %	50 %	399984446
387	NC_018289	CGGG	2	8	15117	15124	0 %	0 %	75 %	25 %	399984446
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